ORCA OUT 与 HESS 结果
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跳转到“目录”路径均相对教程材料根目录。先完成安装。本专题读取现成结果,不需要安装或运行 ORCA。
OUT 是 ORCA 的文本输出;HESS 包含 Hessian、原子、频率及正常模式等原生数据。OUT 与 HESS 的能量和模式各有来源,配对后仍分别保留。
操作步骤
跳转到“操作步骤”1. 导入已验证的现代 OUT
跳转到“1. 导入已验证的现代 OUT”详细说明见附录 A1。
- 用主线的导入入口打开
shared/data/public/orca-v1/orca6-dvb-ir.out。在计算段弹窗核对 ORCA 6.0.1 和结束状态,选择该段后完成导入。 - 选中原子对象,在 科学结果(Scientific Results) 点击 刷新(Refresh)。查看 Vibrational modes 及 ORCA IR raw values,区分 IR 原生
eps、Int、T²和 T 分量。 - 在模式列表选择源模式
6,核对约43.87 cm^-1的原生频率;再显示该模式的位移。截图保存至human/screenshots/ORCA06-native-modes.png。

2. 读取现代 Raman 活性
跳转到“2. 读取现代 Raman 活性”详细说明见附录 A2。
- 分别导入
shared/data/public/orca-v1/orca5-dvb-raman.out或shared/data/public/orca-v1/orca6-dvb-raman.out。 - 在计算段与科学记录中核对版本分别为 5.0.0、6.0.1;在 科学结果(Scientific Results) 查看 ORCA RAMAN raw values。
- 对静态极化率响应依据完整的结果,按专题 13设置 532 nm、298.15 K、Gaussian、FWHM 16 cm^-1、频率缩放 1 后导出 Raman。
3. 导入真实 OUT/HESS 配对
跳转到“3. 导入真实 OUT/HESS 配对”详细说明见附录 A3。
- 打开
shared/data/public/orca-v1/orca4-ts.hess。 - 在导入对话框的 HESS 配套 OUT(可选)(HESS paired OUT (optional)) 选择
shared/data/public/orca-v1/orca4-ts.out,使用第 1 计算段。截图保存至human/screenshots/ORCA04-hess-pair.png。

- 完成导入,按 来源详情(Source Details) 和结果表中的来源记录核对 HESS 与 OUT 配对路径;版本 4.0.1.2 来自配套 OUT,HESS 本身没有版本头,不要求来源弹窗凭空显示版本号。查看约
-503.235928 cm^-1的虚频模式。位移的显示归一化只调节观看尺度,不再次把原生模式做质量加权。 - 在结果表核对能量、电荷、偶极等 OUT 记录与 HESS 模式各自的来源。若原子顺序、坐标或频率不一致,停止配对并找回对应结果,不用不同计算的文件凑成一对。
4. 读取 ORCA 6.1.0 的现代配对
跳转到“4. 读取 ORCA 6.1.0 的现代配对”详细说明见附录 A4。
- 点击 导入 Gaussian / Cube / XYZ / ORCA(Import Gaussian / Cube / XYZ / ORCA),选择
shared/data/public/orca-v1/orca6.1-pentane.hess;在 HESS 配套 OUT(可选)(HESS paired OUT (optional)) 核对并选择同目录orca6.1-pentane.out,不依赖文件名自动证明配对。 - 导入后保持原子对象活动,在 科学结果(Scientific Results) 点击 刷新(Refresh),切到 Vibrational modes。这份真实 pentane TT、r2SCAN-3c OPT FREQ 结果有 17 个原子;排除前 6 个平移/旋转零频模式后应有 45 条振动记录,源模式 6 约为
111.887579 cm^-1。 - 在原生 IR 结果中核对六列及单位,源模式 6 的 Int 为
0.00005399 km/mol。需要观察位移时,可选中模式并使用 预览(Preview);显示尺度不改变原始频率或模式。 - 按共同保存方法保存自包含工程,保留同名
.qcdata/;本片使用 ORCA61-paired-portable.blend。关闭再打开,刷新并核对原生 IR 的源模式 6、强度与单位仍可读取。原生 IR 表含 0–5 零频行,共 51 条记录,与 Vibrational modes 的 45 条振动记录区分;需要进一步核对时,再切换模式表或打开配对来源详情。
附录:参数、原理与输入规范
跳转到“附录:参数、原理与输入规范”A1. ORCA 版本矩阵与原生 IR
跳转到“A1. ORCA 版本矩阵与原生 IR”本轮有真实证据的范围是 OUT 4.0.1.2/5.0.0/6.0.1/6.1.0,以及 4.0.1.2 和 6.1.0 的 OUT/HESS 配对。其他版本仍未验证,不宣称所有 5/6 版本 HESS 都兼容。这里不提供 ORCA NEB 或 Molden 轨道求值。
多作业文件按当前选定计算段读取,不跨作业补几何;失败或中断计算保留状态及已打印记录,不标为收敛的成功结果。输入来源和许可见 sources.json,分发样例时保留同目录 cclib、RMG-Py 和 Kinisot 许可证。
表格与二维图按统一结果与 CSV/SVG导出。工程保存与缺失来源处理沿用共同保存方法和工程来源恢复。
原生模式号可能从 0 开始,不能把列表第几行当作源模式编号。只有原文明确打印 km/mol 的 Int 列用于本轮普通 IR 展宽;未知单位或缺失强度保留为缺失,不由 eps/T² 猜算,也不补成 0。
A2. Raman 活性与静态响应
跳转到“A2. Raman 活性与静态响应”Raman 活性采用 angstrom^4/amu,去偏振比无量纲;它们与换算后的 Stokes 权重分别保存。静态响应未知时,仅保留原始表,不能假定适用非共振换算。6.0.1 例的原始输入 shared/data/public/orca-v1/orca6-dvb-raman.inp 随材料保留,可用于核对计算设置,不要求重新计算。
A3. 旧 HESS 与同任务配对
跳转到“A3. 旧 HESS 与同任务配对”这份旧版 IR 表的 T² 单位未明确,因而不能把它标成 km/mol 或生成普通 IR 强度谱。HESS 单独读取时保留其原生模式;缺少 OUT 伴随信息不会从别的作业继承。
版本身份从配套 OUT 读取,HESS 无版本头。配对失败时保留各自来源,不跨任务补几何或模式。
A4. 现代六列 IR、平移与保存
跳转到“A4. 现代六列 IR、平移与保存”现代 HESS 的 IR 表为 wavenumber eps Int TX TY TZ 六列。成功配对并核对数值后,Int 的单位依据 OUT 的明确标注为 km/mol;保留 HESS 原始精度,例如首个振动的强度为 0.00005399,不能用 OUT 舍入后的 0.00 覆盖。单独打开 HESS 时单位仍为 unknown。这组文件不含 Raman,不能用于验证 6.1.0 Raman。
ORCA 可平移 HESS 的坐标原点。配对允许所有原子共同平移,记录两个原点的差异,仍拒绝原子顺序、质量、内部几何、频率或正常模式不符的文件。